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Serviços

Serviço de genotipagem em larga escala

O GeneChip® Human Mapping 10K Array Xba 142 2.0 da Affymetrix permite a identificação de polimorfismos num único nucleótido (SNP) ao longo do genoma humano (genotipagem), apresentando uma distância média de 105 kb entre cada marcador. São necessários somente 250 ng de DNA para se obterem mais de 10 000 genótipos.

O Affymetrix GeneChip® Human Mapping 100K Set é composto por dois arrays, apresentando cada um deles mais de 50.000 SNPs. Um dos arrays usa a enzima de restrição XbaI e o outro usa HindIII. O conjunto de arrays Mapping 100K é o primeiro de uma família de produtos que permite fazer associações genéticas em todo o genoma, sendo possível obter 100.000 SNPs numa única experiência e a uma distância média entre cada marcador de 8,5 kb (Comparison of Mapping 10K and 100K SNP coverage to 400 marker microsatellite panel).


Os produtos GeneChip® Mapping são uma ferramenta ideal para:

  • Análise de linkage
  • Identificação de alterações no número de cópias dos cromossomas
  • Análise de linkage desiquilibrium
  • Genética populacional e cancro
  • Associações genéticas em todo o genoma (Mapping 100K Set)
O serviço de genotipagem em larga escala tem o seguinte procedimento (tecnologia e diagrama - exemplo para o Array  Mapping 10K 2.0):
  • Aconselhamento sobre a estratégia experimental a seguir, extracção de DNA, etc
  • Restrição do DNA com a endonuclease XbaI
  • Ligação dos adaptadores
  • Amplificação por PCR
  • Fragmentação do DNA e marcação das extremidades das cadeias
  • Hibridação com o GeneChip® Human Mapping 10K 2.0 array
  • Coloração e lavagem do array
  • Leitura da intensidade de fluorescência com o GeneChip® scanner
  • Controlo de qualidade aos dados em bruto usando o software GCOS 1.1 e GDAS 3.0 da Affymetrix
  • Análise computacional dos genótipos obtidos (GDAS 3.0)






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